Changeset 102


Ignore:
Timestamp:
Jun 7, 2012, 4:28:29 PM (5 years ago)
Author:
b.hoekman@…
Message:
 
File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/msCompare/src/runProgram/programParts/openMS/RunOpenMSV17.java

    r80 r102  
    312312                       
    313313                        String outputFileName = param.getInputFiles().getOutputFileForInputFile(input);
    314                         fileName = (new File(outputFileName)).getName();
     314//                      fileName = (new File(outputFileName)).getName();
    315315//                      String outputMZDataFileName = fileName.replaceFirst("mzXML", "mzData");
    316316                        String outputMZDataFileName = "temp.mzML";
     317                       
     318                        //Make a copy!!
     319                        FileUtils.copyFile(new File(input), new File(tmpDir+File.separator+mzDataFileName));
    317320                       
    318321                        String[] commands = null;
     
    364367                        trErr.join(10000);
    365368                       
    366                         FileUtils.copyFile(new File(mzDataFileName), new File(outputFileName));
     369                        FileUtils.copyFile(new File(outputMZDataFileName), new File(outputFileName));
    367370                }               
    368371        }
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.