Changeset 211


Ignore:
Timestamp:
Feb 24, 2010, 1:04:40 PM (7 years ago)
Author:
ademcan
Message:

Study List and Study Overview with Events, eventDescripiton, assays and samples

Location:
trunk
Files:
1 added
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/grails-app/conf/BootStrap.groovy

    r192 r211  
    240240
    241241                        println 'Adding PPSH study'
    242                        
     242
    243243            def humanStudy = new Study(
    244244                                title:"NuGO PPS human study",
  • trunk/grails-app/views/study/show.gsp

    r210 r211  
    3737         <b>Template </b>:<g:link controller="template" action="show" id="${studyInstance?.template?.id}">${studyInstance?.template?.encodeAsHTML()}</g:link><br>
    3838         <b> Start </b>:<g:formatDate date="${studyInstance?.startDate}" /> <br>
     39         <b> Events </b>:
     40         <% def eventList = [] %>
     41
     42          <g:each in="${studyInstance.events}" var="s">
     43            <%  eventList.add(s.eventDescription) %>
     44          </g:each>
     45
     46         <g:if test="${eventList.size()==0}">
     47          -
     48         </g:if>
     49
     50         <g:else>
     51           <% def sampEvent = eventList.get(0).name %>
     52           ${sampEvent}
     53         <g:each in="${eventList}" var="samplingEvent">
     54           <g:if test="${(samplingEvent.name!=sampEvent)}">
     55            ${samplingEvent.name}
     56         </g:if>
     57          </g:each>
     58         </g:else>
     59           <br>
     60
     61
    3962         <b>Sampling Events </b>:
    40 
    4163           <% def tmpList = [] %>
    4264
    43           <g:each in="${studyInstance.events}" var="s">
    44             <g:if test="${s.eventDescription.isSamplingEvent}">
    45             tmpList.add(s.eventDescription)
    46             </g:if>
     65          <g:each in="${studyInstance.samplingEvents}" var="s">
     66            <%  tmpList.add(s.eventDescription) %>
    4767          </g:each>
    4868
     
    5676         <g:each in="${tmpList}" var="samplingEvent">
    5777           <g:if test="${(samplingEvent.name!=sampEvent)}">
    58             ${samplingEvents.name}
     78            ${samplingEvent.name}
    5979         </g:if>
    6080          </g:each>
    6181         </g:else>
    6282           <br>
    63        
    64 
    6583        <b>Last Updated </b>:<g:formatDate date="${studyInstance?.lastUpdated}" /><br>
    66         <b>Readers </b>:<ul>
     84        <b>Readers </b>:
     85
     86        <g:if test="${studyInstance.readers.size()==0}">
     87          -
     88        </g:if>
     89        <g:else>
     90        <ul>
    6791          <g:each in="${studyInstance.readers}" var="r">
    6892            <li><g:link controller="user" action="show" id="${r.id}">${r?.encodeAsHTML()}</g:link></li>
    6993          </g:each>
    70         </ul> <br>
     94        </ul>
     95        </g:else>
     96          <br>
    7197        <b>Code </b>: ${fieldValue(bean: studyInstance, field: "code")} <br>
    72         <b>Editors </b>: <ul>
     98        <b>Editors </b>:
     99          <g:if test="${studyInstance.editors.size()==0}">
     100          -
     101        </g:if>
     102        <g:else>
     103        <ul>
    73104          <g:each in="${studyInstance.editors}" var="e">
    74105            <li><g:link controller="user" action="show" id="${e.id}">${e?.encodeAsHTML()}</g:link></li>
    75106          </g:each>
    76         </ul> <br>
     107        </ul>
     108        </g:else>
     109          <br>
    77110        <b>EC Code </b>: ${fieldValue(bean: studyInstance, field: "ecCode")} <br>
    78111        <b>Research Question </b>: ${fieldValue(bean: studyInstance, field: "researchQuestion")} <br>
     
    143176          <g:each in="${dbnp.studycapturing .Protocol.list()}" var="s">
    144177           
    145             <% if  (studyInstance.events.eventDescription.protocol.contains(s)) { %>
     178            <% if  ((studyInstance.events.eventDescription.protocol.contains(s))||
     179              (studyInstance.samplingEvents.eventDescription.protocol.contains(s))) { %>
    146180           
    147181            <tr>
     
    175209          <g:each in="${studyInstance.events}" var="e">
    176210            <tr>
    177              
    178211          <td><g:link controller="event" action="edit" id="${e.id}">${e.subject.id}</g:link></td>
    179212          <td>${e.getPrettyDuration(studyInstance.startDate,e.startTime)}</td>
    180213          <td>${e.getPrettyDuration()}</td>
    181214           <td><g:link controller="event" action="show" id="${e.id}">  ${e.eventDescription.name}</g:link></td>
    182           <g:if test="${e.eventDescription.isSamplingEvent}">
    183             <td><input type="checkbox" id="" disabled="false" value="true"></td>
    184           </g:if>
    185           <g:else>
    186             <td><input type="checkbox" id="" disabled="false" value="false"></td>
    187           </g:else>
     215            <td><g:checkBox name="event" disabled="${true}" value="${false}"/></td>
    188216          <td>${e.eventDescription.protocol.parameters.name}</td>
    189217          </tr>
    190218          </g:each>
     219
     220          <g:each in="${studyInstance.samplingEvents}" var="e">
     221            <tr>
     222          <td><g:link controller="event" action="edit" id="${e.id}">${e.subject.id}</g:link></td>
     223          <td>${e.getPrettyDuration(studyInstance.startDate,e.startTime)}</td>
     224          <td>${e.getPrettyDuration()}</td>
     225           <td><g:link controller="event" action="show" id="${e.id}">  ${e.eventDescription.name}</g:link></td>
     226            <td><g:checkBox name="samplingEvent" disabled="${true}" value="${true}"/>
     227            </td>
     228          <td>${e.eventDescription.protocol.parameters.name}</td>
     229          </tr>
     230          </g:each>
     231
    191232          </table>
    192233      </div>
     
    196237          <tr>
    197238
    198             <td><b>Name</b></td>
     239            <td><b>Event Name</b></td>
    199240            <td><b>Parameters </b></td>
    200241          </tr>
     
    229270            </g:if>
    230271            </g:each>
     272
     273           <g:each in="${dbnp.studycapturing.EventDescription.list()}" var="e">
     274          <g:if test="${(studyInstance.samplingEvents.eventDescription.contains(e))}" >
     275            <tr>
     276              <td>${e.name} </td></tr><tr>
     277            <g:each in="${e.protocol.parameters}" var="p">
     278              <td></td>
     279          <td>${p.name}</td>
     280          <td>${p.description}</td>
     281          <td>${p.unit}</td>
     282          <td>${p.reference}</td>
     283          <g:if test="${(p.listEntries.size()==0)}" >
     284          <td>-</td>
     285            </g:if>
     286          <g:else>
     287          <td>${p.listEntries}</td>
     288          </g:else>
     289          <td>${p.type}</td>
     290            </tr>
     291            </g:each>
     292            </g:if>
     293            </g:each>
     294
    231295          </table>
    232296
    233         <g:form>
    234    
    235       <span class="button"><g:actionSubmit class="event" action="create" value="${message(code: 'default.button.create.label', default: 'Create')}" /></span>
     297        <g:form controller="eventDescription" action="create">
     298         <INPUT TYPE=submit name=submit Value="New Event Description">
    236299    </g:form>
    237300
     
    243306        </g:if>
    244307        <g:else>
     308          <table>
     309            <tr>
     310              <td width="100"><b>Assay Name</b></td>
     311              <td width="100"><b>Module</b></td>
     312              <td><b>Type</b></td>
     313              <td width="150"><b>Platform</b></td>
     314              <td><b>Url</b></td>
     315              <td><b>Samples</b></td>
     316            </tr>
    245317          <g:each in="${studyInstance.assays}" var="assay">
    246             ${assay.name}
    247           </g:each>
     318            <tr>
     319            <td>${assay.name}</td>
     320            <td>${assay.module.name}</td>
     321            <td>${assay.module.type}</td>
     322            <td>${assay.module.platform}</td>
     323            <td>${assay.module.url}</td>
     324            <td>
     325              <g:each in="${assay.samples}" var="assaySample">
     326                ${assaySample.name}<br>
     327              </g:each>
     328            </td>
     329            </tr>
     330          </g:each>
     331
     332          </table>
    248333        </g:else>
    249334      </div>
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.