Changeset 1570

Show
Ignore:
Timestamp:
25-02-11 17:18:49 (3 years ago)
Author:
robert@…
Message:

Small bugfixes of bugs that appeared during deployment of metagenomics module

Location:
trunk/grails-app
Files:
4 modified

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/grails-app/conf/BaseFilters.groovy

    r1436 r1570  
    4141                        afterView = { 
    4242                                def actionDuration = request._timeAfterRequest ? request._timeAfterRequest - request._timeBeforeRequest : 0 
    43                                 def viewDuration = System.currentTimeMillis() - request._timeAfterRequest 
     43                                def viewDuration = request._timeAfterRequest ? System.currentTimeMillis() - request._timeAfterRequest : 0 
    4444                                log.info("Timer: ${controllerName}(${actionDuration}ms)::${actionName}(${viewDuration}ms)") 
    4545                        } 

  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/studycapturing/PublicationController.groovy

    r1565 r1570  
    3434         
    3535                // Check whether the autorsList is not too long. If it is, split it 
    36                 println "authors length: " + publication.authorsList.size() 
    3736                if( publication.authorsList.size() > 255 ) { 
    3837                        def postfix = " et al."; 
    3938                        def split = publication.authorsList[ 0..255 - postfix.size()].lastIndexOf( ", " ); 
    4039                        publication.authorsList = publication.authorsList[ 0..split-1] + postfix; 
    41                          
    42                         println "new authors list: " + publication.authorsList.size() + " - " + publication.authorsList 
    4340                } 
    4441 
    … …  
    173170                         
    174171                                // Check whether the autorsList is not too long. If it is, split it 
    175                                 println "authors length: " + publication.authorsList.size() 
    176172                                if( publication.authorsList.size() > 255 ) { 
    177173                                        def postfix = " et al."; 
    178174                                        def split = publication.authorsList[ 0..255 - postfix.size()].lastIndexOf( ", " ); 
    179175                                        publication.authorsList = publication.authorsList[ 0..split-1] + postfix; 
    180                                          
    181                                         println "new authors list: " + publication.authorsList.size() + " - " + publication.authorsList 
    182176                                } 
    183177                         

  • trunk/grails-app/controllers/RestController.groovy

    r1512 r1570  
    346346 
    347347                                assays.each{ assay -> 
    348                                         if (assay.module.url.equals(params.consumer)) { 
     348                                        if (assay.module?.url && assay.module.url.equals(params.consumer)) { 
    349349                                                if(assay) { 
    350350                                                        def map = [assayToken : assay.giveUUID()] 

  • trunk/grails-app/views/study/show_assays.gsp

    r1526 r1570  
    2929                        <td>${assay.token}</td> 
    3030                  <td>${assay.name}</td> 
    31                   <td>${assay.module.name}</td> 
    32                   <td>${assay.module.platform}</td> 
     31                  <td>${assay.module?.name}</td> 
     32                  <td>${assay.module?.platform}</td> 
    3333                  <td> 
    3434                        <g:if test="${assay.module.openInFrame == null || assay.module.openInFrame == Boolean.TRUE}">