Ignore:
Timestamp:
Jan 31, 2011, 1:27:30 PM (10 years ago)
Author:
business@…
Message:

moved gdt package to org.dbnp, moved tests for RelTime?, TemplateEntity?, Template etc. to gdt plugin

Location:
trunk/grails-app/controllers/dbnp
Files:
7 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/exporter/ExporterController.groovy

    r1430 r1456  
    1616
    1717import dbnp.studycapturing.*
     18import org.dbnp.gdt.*
    1819
    1920import org.apache.poi.hssf.util.HSSFColor
     
    210211        println "----- SUBJECT -----"
    211212        for (u in 0..sample.parentSubject.giveFields().unique().size()-1){
    212             nl.grails.plugins.gdt.TemplateField tf = sample.parentSubject.giveFields().getAt(u)
     213            TemplateField tf = sample.parentSubject.giveFields().getAt(u)
    213214            println tf.name
    214215            row.createCell((short)9+u).setCellValue(tf.name)
     
    221222        println "----- SAMPLING EVENT -----"
    222223        for (t in 0..sample.parentEvent.giveFields().unique().size()-1){
    223             nl.grails.plugins.gdt.TemplateField tf =sample.parentEvent.giveFields().getAt(t)
     224            TemplateField tf =sample.parentEvent.giveFields().getAt(t)
    224225            println tf.name
    225226            row.createCell((short)9+sample.parentSubject.giveFields().unique().size()+t).setCellValue("samplingEvent-"+tf.name)
     
    237238        println "----- SAMPLE -----"
    238239        for (v in 0..sample.giveFields().unique().size()-1){
    239             nl.grails.plugins.gdt.TemplateField tf =sample.giveFields().getAt(v)
     240            TemplateField tf =sample.giveFields().getAt(v)
    240241            println tf.name
    241242            row.createCell((short)9+sample.parentSubject.giveFields().unique().size()+v+sample.parentEvent.giveFields().unique().size()).setCellValue("sample-"+tf.name)
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/importer/ImporterController.groovy

    r1444 r1456  
    22
    33import dbnp.studycapturing.*
    4 import nl.grails.plugins.gdt.*
    5 import org.apache.poi.ss.usermodel.Workbook
     4
    65import grails.converters.JSON
    76//import cr.co.arquetipos.crypto.Blowfish
    87import org.codehaus.groovy.grails.plugins.web.taglib.ValidationTagLib
    98import grails.plugins.springsecurity.Secured
    10 import org.hibernate.SessionFactory
    119
    1210/**
     
    415413                                entity.giveFields().each { field ->
    416414                                        // field of type ontology and value "#invalidterm"?
    417                                         if (field.type == nl.grails.plugins.gdt.TemplateFieldType.ONTOLOGYTERM &&
     415                                        if (field.type == org.dbnp.gdt.TemplateFieldType.ONTOLOGYTERM &&
    418416                                                params["entity_" + entity.getIdentifier() + "_" + field.escapedName()] == "#invalidterm"
    419417                                        ) {
    420418                                                invalidontologies++
    421419                                        } else
    422                                         if (field.type == nl.grails.plugins.gdt.TemplateFieldType.ONTOLOGYTERM &&
     420                                        if (field.type == org.dbnp.gdt.TemplateFieldType.ONTOLOGYTERM &&
    423421                                                params["entity_" + entity.getIdentifier() + "_" + field.escapedName()] != "#invalidterm") {
    424422                                                removeFailedCell(flow.importer_failedcells, entity)
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/query/AdvancedQueryController.groovy

    r1432 r1456  
    11package dbnp.query
    2 
    3 import dbnp.studycapturing.*
    4 import nl.grails.plugins.gdt.*
    52
    63// TODO: Make use of the searchable-plugin possibilities instead of querying the database directly
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/studycapturing/AssayModuleController.groovy

    r1430 r1456  
    1515package dbnp.studycapturing
    1616
    17 import nl.grails.plugins.gdt.*
    18 
    1917class AssayModuleController {
    2018        // Scaffold this class to circumvent not being able to add assays (0.4)
    21         def scaffold = nl.grails.plugins.gdt.AssayModule
     19        def scaffold = org.dbnp.gdt.AssayModule
    2220}
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/studycapturing/StudyController.groovy

    r1440 r1456  
    33import grails.converters.*
    44import grails.plugins.springsecurity.Secured
    5 import nl.grails.plugins.gdt.TemplateFieldType
     5import org.dbnp.gdt.TemplateFieldType
     6import org.dbnp.gdt.RelTime
     7
    68
    79/**
     
    314316                                if( value ) {
    315317                                        if( templateField.type == TemplateFieldType.RELTIME )
    316                                                 value = new nl.grails.plugins.gdt.RelTime( value ).toString();
     318                                                value = new RelTime( value ).toString();
    317319
    318320                        def param = templateField.name + " = " + value;
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/studycapturing/StudyWizardController.groovy

    r1430 r1456  
    11package dbnp.studycapturing
    22
    3 import dbnp.data.*
    4 import grails.converters.*
    53import grails.plugins.springsecurity.Secured
    6 import dbnp.authentication.AuthenticationService
     4
    75import dbnp.authentication.SecUser
    86import org.codehaus.groovy.grails.plugins.web.taglib.ValidationTagLib
    9 import nl.grails.plugins.gdt.*
     7import org.dbnp.gdt.RelTime
    108
    119/**
     
    15531551                                                                def samplingEventName = ucwords(event.template.name)
    15541552                                                                def eventGroupName = ucwords(eventGroup.name).replaceAll("([ ]{1,})", "")
    1555                                                                 def sampleName = (ucwords(subject.name) + '_' + samplingEventName + '_' + eventGroupName + '_' + new nl.grails.plugins.gdt.RelTime(event.startTime).toString()).replaceAll("([ ]{1,})", "")
     1553                                                                def sampleName = (ucwords(subject.name) + '_' + samplingEventName + '_' + eventGroupName + '_' + new RelTime(event.startTime).toString()).replaceAll("([ ]{1,})", "")
    15561554                                                                def tempSampleIterator = 0
    15571555                                                                def tempSampleName = sampleName
     
    16491647                                                        def samplingEventName = ucwords(samplingEvent.template.name)
    16501648                                                        def eventGroupName = ucwords(eventGroup.name)
    1651                                                         def sampleName = (ucwords(subject.name) + '_' + samplingEventName + '_' + eventGroupName + '_' + new nl.grails.plugins.gdt.RelTime(samplingEvent.startTime).toString()).replaceAll("([ ]{1,})", "")
     1649                                                        def sampleName = (ucwords(subject.name) + '_' + samplingEventName + '_' + eventGroupName + '_' + new RelTime(samplingEvent.startTime).toString()).replaceAll("([ ]{1,})", "")
    16521650                                                        def tempSampleIterator = 0
    16531651                                                        def tempSampleName = sampleName
  • trunk/grails-app/controllers/dbnp/studycapturing/TermEditorController.groovy

    r1430 r1456  
    1414 */
    1515package dbnp.studycapturing
    16 
    17 import nl.grails.plugins.gdt.*
    1816
    1917class TermEditorController {
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.