Changeset 1046


Ignore:
Timestamp:
Nov 2, 2010, 10:25:06 AM (6 years ago)
Author:
m.s.vanvliet@…
Message:

Update NMC Pilot pages

Location:
trunk/grails-app
Files:
1 deleted
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/grails-app/conf/BootStrapTemplates.groovy

    r870 r1046  
    229229                .with { if (!validate()) { errors.each { println it} } else save()}
    230230
     231               
     232                /*
     233                 * Add NMC - DCL Sample Mapping Template
     234                 * by Michael van Vliet
     235                 *
     236                 * For the Pilot running in Leiden (NOV2010)
     237                 */
     238                println ".adding sample DCL-Sample-Reference"
     239                def sampleDCLTextField = new TemplateField(
     240                        name: 'DCL Sample Reference',
     241                        type: TemplateFieldType.STRING,
     242                        entity: Sample
     243                )
     244                .with { if (!validate()) { errors.each { println it} } else save()}
     245
     246                // Human tissue sample template
     247                println ".adding DCL Sample template..."
     248                def dclSampleTemplate = new Template(
     249                        name: 'DCL Sample information',
     250                        entity: dbnp.studycapturing.Sample
     251                )
     252                .addToFields(sampleDCLTextField)
     253                .with { if (!validate()) { errors.each { println it} } else save()}
     254                // EO DCL Sample Mapping Template**********************************
     255               
     256               
    231257                /*
    232258                def GrowthTreatmentTemplate = new Template(
  • trunk/grails-app/controllers/nmc/PilotController.groovy

    r959 r1046  
    3636       
    3737    def index = {
    38        
     38               
     39                def studyInstance = new Study()
     40                studyInstance.properties = params
     41               
     42                [studyInstanceList: Study.list(params), studyInstance: studyInstance]
    3943    }
    4044
     
    4347        [studyInstanceList: Study.list(params), studyInstanceTotal: Study.count()]
    4448    }
    45        
    46         /**
    47         * create closure
    48         */
    49    def create = {
    50            def studyInstance = new Study()
    51            studyInstance.properties = params
    52            return [studyInstance: studyInstance]
    53    }
    54    
     49         
    5550   def save = {
    5651           def studyInstance = new Study(params)
     
    8075           }
    8176           else {
    82                    render(view: "create", model: [studyInstance: studyInstance])
     77                   render(view: "index", model: [studyInstance: studyInstance])
    8378           }
    8479   }
  • trunk/grails-app/views/pilot/index.gsp

    r959 r1046  
    1111        <p>Thank you for participating in the 2010 Pilot of the NMC-DSP/GSCF application</p>
    1212        <br />
    13         <center>
    14                 <g:link action="create" ><font size="+5" style="padding: 5px; border: 2px solid #CDCDCD;">Start here</font></g:link>
    15         </center>
    16         <br />
    17         <br />
     13        <table>
     14                <tr>           
     15        <g:if test="${studyInstanceList}">
     16                <td width="50%">
     17                        <h3>Continue with an existing Pilot Study</h3>
     18                        <g:each in="${studyInstanceList}" var="study">
     19                                - <g:link controller="pilot" action="show" id="${study.id}">${study.title}</g:link><br />
     20                        </g:each>
     21                </td>
     22        </g:if>
     23        <td width="50%">
     24                <h3>Start new Pilot here</h3>
     25        <g:if test="${flash.message}">
     26                <div class="message">${flash.message}</div>
     27        </g:if>
     28     
     29        <g:hasErrors bean="${studyInstance}">
     30                <div class="errors">
     31                        <g:renderErrors bean="${studyInstance}" as="list" />
     32                </div>
     33        </g:hasErrors>
     34       
     35        <g:form action="save" method="post" >
     36          <div class="dialog">
     37                <p>Start by creating a study. For this pilot a title and start date are sufficient. When finished click on the "Create/Invoeren" button.</p>
     38              <table>
     39                  <tbody>
     40
     41                      <tr class="prop">
     42                          <td valign="top" class="name">
     43                              <label for="title"><g:message code="study.title.label" default="Title" /></label>
     44                          </td>
     45                          <td valign="top" class="value ${hasErrors(bean: studyInstance, field: 'title', 'errors')}">
     46                              <g:textField name="title" value="${studyInstance?.title}" />
     47                          </td>
     48                      </tr>
     49                     
     50                      <tr class="prop">
     51                          <td valign="top" class="name">
     52                              <label for="startDate"><g:message code="study.startDate.label" default="Start Date" /></label>
     53                          </td>
     54                          <td valign="top" class="value ${hasErrors(bean: studyInstance, field: 'startDate', 'errors')}">
     55                              <g:datePicker name="startDate" precision="day" value="${studyInstance?.startDate}"  />
     56                          </td>
     57                      </tr>                           
     58                     
     59                  </tbody>
     60              </table>
     61          </div>
     62          <div class="buttons">
     63             <g:each in="${extraparams}" var="param">
     64               <input type="hidden" name="${param.key}" value="${param.value}">
     65             </g:each>               
     66             <span class="button"><g:submitButton name="create" class="save" value="${message(code: 'default.button.create.label', default: 'Create')}" /></span>
     67             <span class="button"><g:link class="cancel" action="list" params="${extraparams}">Cancel</g:link></span>
     68          </div>
     69      </g:form>
     70    </td>
     71  </tr>
     72</table>
     73<br /><br />
    1874</body>
    1975</html>
  • trunk/grails-app/views/pilot/show.gsp

    r959 r1046  
    1818                        <b>Instructions</b>: You are now on the Study page.
    1919                        All information within the application is related to a study.
    20                         For this pilot a Metabolomics Assay has been created.
    21                         Click on this assay to continue with the pilot.
     20                        For this pilot a Metabolomics Assay has been created.<br /><br />
     21                       
     22                                        <g:if test="${studyInstance.samples.size() == 0}">
     23                        Currently there are no samples registered for this study. Please use the <b>"Import Samples"</b> to add samples to this study.                         
     24                                        </g:if>
     25
     26                                        <g:if test="${studyInstance.samples.size() > 0}">
     27                                Click on this assay to continue with the pilot.
     28                                        </g:if>
     29                       
     30
    2231                </p>
    2332                <table>
     
    2736                            <td valign="top" class="name"><g:message code="study.title.label" default="Title" /></td>
    2837
    29                             <td valign="top" class="value">${fieldValue(bean: studyInstance, field: "title")}</td>
     38                            <td valign="top" class="value">${fieldValue(bean: studyInstance, field: "title")} (${fieldValue(bean: studyInstance, field: "code")})</td>
    3039
    3140                        </tr>
    3241                        <tr class="prop">
    33                             <td valign="top" class="name"><g:message code="study.code.label" default="Code" /></td>
     42                            <td valign="top" class="name">Samples (${studyInstance.samples.size()})</td>
    3443
    35                             <td valign="top" class="value">${fieldValue(bean: studyInstance, field: "code")}</td>
     44                            <td valign="top" class="value">
     45                               
     46                                <g:if test="${studyInstance.samples.size() == 0}">
     47                                        <g:link controller="importer" action="simpleWizard">Import Samples</g:link>                                     
     48                                </g:if>
     49                               
     50                                <g:if test="${studyInstance.samples.size() > 0}">
     51                                                                        ${studyInstance.samples.join( ', ' )}                                           
     52                                </g:if>                                 
     53                            </td>
    3654
    3755                        </tr>
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.