source: trunk/grails-app/conf/BootStrap.groovy @ 92

Last change on this file since 92 was 92, checked in by duh, 11 years ago
  • added sample template data in bootstrap
  • upgraded jQuery
  • improved study capture wizard
  • fixed selenium test
  • Property svn:keywords set to Date Author Rev
File size: 1.4 KB
Line 
1import org.codehaus.groovy.grails.commons.GrailsApplication
2import grails.util.GrailsUtil
3import dbnp.studycapturing.*
4import intient.nimble.InstanceGenerator
5
6/**
7 * Application Bootstrapper
8 * @Author Jeroen Wesbeek
9 * @Since 20091021
10 *
11 * Revision information:
12 * $Rev: 92 $
13 * $Author: duh $
14 * $Date: 2010-01-19 13:25:45 +0000 (di, 19 jan 2010) $
15 */
16class BootStrap {
17        def init = {servletContext ->
18                if (GrailsUtil.environment == GrailsApplication.ENV_DEVELOPMENT) {
19                        printf("development bootstrapping....\n\n");
20
21                        // ontologies
22                        def speciesOntology = new Ontology(
23                                name: 'Species',
24                                shortName: 'Species',
25                                url: 'http://www.obofoundry.org/cgi-bin/detail.cgi?id=ncbi_taxonomy'
26                        ).save()
27
28                        // terms
29                        def mouseTerm = new Term(
30                                name: 'Mus musculus',
31                                ontology: speciesOntology,
32                                accession: '10090'
33                        ).save()
34                        def humanTerm = new Term(
35                                name: 'Homo sapiens',
36                                ontology: speciesOntology,
37                                accession: '9606'
38                        ).save()
39
40                        // create system user
41                        /*
42                        def systemUser = userService.createUser(InstanceGenerator.user(
43                                username: 'system',
44                                pass: 'system',
45                                passConfirm: 'system',
46                                enabled: true
47                        ))
48                        */
49
50                        // define template fields
51                        def genotypeTemplateField = new TemplateSubjectField(
52                                name: 'Genotype',
53                                type: TemplateFieldType.STRINGLIST
54                        ).save()
55
56                        // Mouse template
57                        def mouseTemplate = new Template(
58                                name: 'Mouse'
59                        ).addToSubjectFields(genotypeTemplateField).save()
60                }
61        }
62
63        def destroy = {
64        }
65} 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.