source: trunk/grails-app/views/assay/index.gsp @ 26

Last change on this file since 26 was 26, checked in by robert@…, 9 years ago

Small fixes

File size: 2.2 KB
Line 
1<html>
2        <head>
3                <meta name="layout" content="main" />
4                <title>List assays | Metagenomics | dbNP</title>
5        </head>
6        <body>
7                <h1>List of metagenomics assays</h1>
8                <g:if test="${studies.size() == 0}">
9                        <p>
10                                Currently there are no studies available in the database. Please use <a href="${gscfAddUrl}">GSCF</a> to add new studies.
11                        </p>
12                </g:if>
13                <g:else>
14                        <form id="assayForm">
15                        </form>
16                        <table id="assays" class="paginate">
17                                <thead>
18                                        <tr>
19                                                <th class="nonsortable"><input type="checkbox" id="checkAll" onClick="checkAllPaginated(this);" /></th>
20                                                <th>Assay</th>
21                                                <th>Study</th>
22                                                <th># samples</th>
23                                                <th>avg sequences / sample</th>
24                                                <th class="nonsortable"></th>
25                                        </tr>
26                                </thead>
27                                <tbody>
28                                        <g:each in="${studies}" var="study">
29                                                <g:if test="${study.assays != null && study.assays.size() > 0}">
30                                                        <g:each in="${study.assays}" var="assay">
31                                                                <tr>
32                                                                        <td><g:checkBox name="ids" value="${assay.id}" checked="${false}" onClick="updateCheckAll(this);" /></td>
33                                                               
34                                                                        <td><g:link controller="assay" action="show" id="${assay.id}">${assay.name}</g:link></td>
35                                                                        <td><a href="${study.viewUrl()}">${study.name}</a></td>
36                                                                        <td>${assay.assaySamples?.size()}</td>
37                                                                        <td>
38                                                                                <g:if test="${assay.assaySamples?.size()}">
39                                                                                        <g:formatNumber number="${assay.numSequences() / assay.assaySamples?.size()}" format="0"/>
40                                                                                </g:if>
41                                                                                <g:else>
42                                                                                        -
43                                                                                </g:else>
44                                                                        </td>
45                                                                        <td><g:link controller="assay" action="show" id="${assay.id}"><img src="${fam.icon( name: 'application_form_magnify' )}" alt="view" title="view" /></g:link></td>
46                                                                       
47                                                                </tr>
48                                                        </g:each>
49                                                </g:if>
50                                        </g:each>
51                                </tbody>
52                        </table>
53                        <p class="options">
54                                <a class="fasta" href="#" onClick="submitPaginatedForm( $( '#assayForm' ), '<g:createLink action="exportAsFasta" />', '#assays', 'Please select an assay to export' ); return false;">Export as fasta</a>
55                                <a class="excel" href="#" onClick="submitPaginatedForm( $( '#assayForm' ), '<g:createLink action="exportMetaData" />', '#assays', 'Please select an assay to export' ); return false;">Export metadata</a>
56                        </p>
57                       
58                </g:else>                       
59        </body>
60</html>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.