source: index.html @ 4

Last change on this file since 4 was 1, checked in by ishtiaq.ahmad@…, 9 years ago

adding daf portal first time
File size: 12.7 KB
RevLine 
[1]1<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "DTD/xhtml1-transitional.dtd">
2<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" >
3        <head>
4                <title>Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform (NBPP)</title>       
5                <script type="text/javascript">var _sf_startpt=(new Date()).getTime()</script>
6                <script type="text/javascript" src="http://www.google.com/jsapi"></script>
7                <script type="text/javascript">google.load("jquery", "1.4.2");</script>
8                <script type="text/javascript" src="worth1000.ui.js"></script> 
9                <link href="worth1000.css" type="text/css" rel="stylesheet" />                 
10                <link rel="Shortcut icon" href="/favicon.ico" type="image/x-icon" />
11                <meta http-equiv="CONTENT-TYPE" content="TEXT/HTML; CHARSET=UTF-8" />
12                <meta name="Content-language" content="en-US" />
13                <meta name="author" content="Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform (NBPP)" />
14                <meta name="copyright" content="Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform (NBPP)" />
15                <meta name="description" content="Data Analysis Framework" />
16                <meta name="keywords" content="Bioinformatics, Informatics, Proteomics,Proteomics Research, Protein biomarker, protein biomarker discovery, Biomarker discovery, Biomarker, NBPP, Netherlands Bioinformatics, Netherlands Bioinformatics Center, Netherlands Proteomics Centre, Dutch Life Science Grid, Warp2D, 2D Time Alignment, Time Alignment, LC-MS Data, LC-MS, LC / MS, Disease Candidate, Mass Spectrometry, Analytical Biochemistry, Data Acquisition, Data Processing, Statical Analysis, HPC, Scientific Computing, Parallel computing, Proteomics Platform, Data Analysis, Framework, Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform, Web services, DAF, Data Analysis Framework" />
17                <meta name="google-site-verification" content="2fJa3B4CZnAmE7dp-Cy_6WZXlDTgkqh7fNno_F7BtnE" />
18                <meta name="google-site-verification" content="FAyqMA_bkmwslsqVimqN7DKy5osZlj3fuqD86dMlEKo" />
19                <meta name="alexaVerifyID" content="Ki8H-YNk5bo8Oc-avtQOwBTh8Sk" />
20                <META name="y_key" content="c76aa78e30c936b9" />
21                <META name="y_key" content="1a93dbd10d9a99c3" />
22                <script type="text/javascript">
23                        var varIsAdmin = 1;
24                        var varIsCouncil = 1;
25                 function jSignin(){
26                        var post_data;
27                        $.ajax({
28                           type: "POST",
29                           url: "forms/signin.php",
30                           data: post_data + "&dh=" + new Date().getTime(),
31                           dataType: "html",
32                           success:function(login_html){
33                                        $.facebox(login_html);
34                                        initializeFacebox();
35                           }
36                        });
37                }
38
39                </script>
40<script type="text/javascript">
41  var rpxJsHost = (("https:" == document.location.protocol) ? "https://" : "http://static.");
42  document.write(unescape("%3Cscript src='" + rpxJsHost +
43"rpxnow.com/js/lib/rpx.js' type='text/javascript'%3E%3C/script%3E"));
44</script>
45<script type="text/javascript">
46  RPXNOW.overlay = true;
47  RPXNOW.language_preference = 'en';
48</script>
49<script type="text/javascript">
50  var _gaq = _gaq || [];
51  _gaq.push(['_setAccount', 'UA-16369638-2']);
52  _gaq.push(['_setDomainName', '.nbpp.nl']);
53  _gaq.push(['_trackPageview']);
54
55  (function() {
56    var ga = document.createElement('script'); ga.type = 'text/javascript'; ga.async = true;
57    ga.src = ('https:' == document.location.protocol ? 'https://ssl' : 'http://www') + '.google-analytics.com/ga.js';
58    var s = document.getElementsByTagName('script')[0]; s.parentNode.insertBefore(ga, s);
59  })();
60</script>
61                <style type="text/css" >
62                        a {
63                                color:#0094F7;
64                        }       
65               
66                        #logo-img img {
67                       
68                                background:#fff url('logo.png');                               
69                       
70                        }
71                       
72                        #logo-tag a {
73                                color:#555
74                        }
75                </style>
76                       
77        </head>
78        <body>
79        <div id="body-proxy-l">
80        <div id="body-proxy-r"> 
81                <div id="body-container">
82                        <div id="main">
83
84        <div id="header">
85                <div id="header-container">
86                        <div id="login-options">
87                       
88        <div><a href="/login" class="login" onclick="jLogin(1);return false">Login</a> <!-- <a  href="https://nbpp.rpxnow.com/openid/v2/signin?token_url=http%3A%2F%2Fwww2.nbpp.nl%2Frpxnow%2Ftoken_url.php" onclick="return false;" class="rpxnow">Sign In</a> -->  or <a href="/login" class="register" onclick="jLogin(2);return false">Create an account!</a></div>
89
90                        </div> 
91               
92                        <div id="logo">
93                                <div id="logo-img">
94                                        <a href="http://www.nbpp.nl/"><img src="logo.png"  alt="Netherlands Bioinformatics For Proteomics Platform - NBPP"/></a>
95                                </div>
96                                <div id="logo-tag">
97                                       
98                                        <form action="#" method="get">                                 
99                                        <div class="searchbar">
100                                                <input name="search" value="" id="search" onfocus="filterList(1)" onblur="filterList(0);return false" />                                                                <a href="search" class="searchicon" onclick="isearch();return false;"><img src="http://s3.amazonaws.com/worth1000media/images/search.png" alt="search"/></a>
101                                        </div>
102                                        </form>
103                                </div>
104                                <div class="nav-holder">
105                                                <ul class="nav-list">
106                                                <li class="selected"><a href="/">Home</a></li>
107                                                <li><a href="services.html">Services</a></li>
108                                                <li><a href="workflow.html">Workflow</a></li>
109                                                <li><a href="https://wiki.nbic.nl/index.php/Proteomics_software_frameworks">Tools</a></li>
110                                                <li><a href="https://wiki.nbic.nl/index.php/NBPP">NBPP Wiki</a></li>
111                                                </ul>
112                                       
113                                </div>
114                        </div>
115                       
116                       
117
118                </div>
119               
120
121        <!--FILTER MODULE-->
122        <div id="filter-options-container">     
123               
124        </div>
125
126               
127               
128        </div>
129       
130
131       
132        <div id="header-liner">
133                &nbsp;
134        </div>
135               
136                       
137
138
139
140<div id="body-col-right">
141
142                <div style="margin-bottom:20px">
143                        <div class="module-header">
144                                <div class="module-header-right" style="width:125px;">
145                                        <div class="module-header-show-more">
146                                                <div class="call-out-container">                                                       
147                                                        <div class="btns-unsubscribe"  >
148                                                                <div class="call-out-secondary">                                       
149                                                               
150                                                                        <a href="forms/form-login-register.php?msg=joindaf" rel="facebox" class="btn">+ Join DAF</a>           
151
152                                                                       
153                                                                </div>                                 
154                                                        </div>
155                                                                       
156                                                </div>
157                               
158                                       
159                                        </div>
160                                </div>
161                                <div class="module-header-left" style="font-size:12pt;" >
162                                        Data Analysis Framework
163                                </div>
164                        </div> 
165                       
166                        <div id="about_daf" class="right-section">             
167                                <div class="about-content">
168                                        <p>Data Analysis Framework (DAF) is an infrastructure program providing data processing services based on integrated tools. DAF is open source and the source code in java is available <a href="http://gbic.target.rug.nl/trac/daf/" class="login" >here.</a></p>
169<p>You can use the data processing services provided by DAF by clicking on the orange "+ Join DAF" button.</p> 
170                                </div> 
171                               
172
173
174                        </div>
175                </div>
176               
177
178                <div class="clear-left"></div>                         
179
180               
181                <div style="margin-bottom:20px">
182                <!-- Include the Google Friend Connect javascript library. -->
183                <script type="text/javascript" src="http://www.google.com/friendconnect/script/friendconnect.js"></script>
184                <!-- Define the div tag where the gadget will be inserted. -->
185                <div class="module-header" id="div-723660123540898109"  style="300px;border:1px solid #dfdfdf;"></div>
186                <!-- Render the gadget into a div. -->
187                <script type="text/javascript">
188                        var skin = {};
189                        skin['BORDER_COLOR'] = '#dfdfdf';
190                        skin['ENDCAP_BG_COLOR'] = '#e0e0e0';
191                        skin['ENDCAP_TEXT_COLOR'] = '#333333';
192                        skin['ENDCAP_LINK_COLOR'] = '#0094F7';
193                        skin['ALTERNATE_BG_COLOR'] = '#ffffff';
194                        skin['CONTENT_BG_COLOR'] = '#ffffff';
195                        skin['CONTENT_LINK_COLOR'] = '#0094F7';
196                        skin['CONTENT_TEXT_COLOR'] = '#555';
197                        skin['CONTENT_SECONDARY_LINK_COLOR'] = '#7777cc';
198                        skin['CONTENT_SECONDARY_TEXT_COLOR'] = '#666666';
199                        skin['CONTENT_HEADLINE_COLOR'] = '#333333';
200                        skin['NUMBER_ROWS'] = '6';
201                        google.friendconnect.container.setParentUrl('/' /* location of rpc_relay.html and canvas.html */);
202                        google.friendconnect.container.renderMembersGadget(
203                         { id: 'div-723660123540898109',
204                           site: '13911688949681048542' },
205                          skin);
206                        </script>
207                </div>
208               
209                <div class="clear-left"></div> 
210</div>
211<div id="body-col-left">
212
213       
214        <div style="display:none">
215
216        </div>
217       
218        <div style="border-top:1px solid #ffffff">
219        </div>
220               
221       
222        <!--ENTER MODULE-->
223        <div id="home-enter" class="module-container margin">                   
224                <div class="module-header">
225                        <div class="module-header-right mthin">
226                                        <div class="module-header-show-more">
227                                                <a class="btn" rel="facebox" href="forms/form-contact-us.php"><span><span>Contact Us</span></span></a>
228                                        </div>                 
229                        </div>
230                        <div class="module-header-left mhuge">
231                        <span class="capslock">Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform (NBPP)</span></div>
232                </div>
233                <div class="module-content">
234                        <div class="data-table" style="margin-bottom:40px">     
235                                <div style="margin-bottom:20px;margin-left:10px;text-align:justify">
236 <img src="nbic_logo.png" width="200" height="44"  style="border: 0px solid ;vertical-align:top" alt="Netherlands Bioinformatics Center" title="Netherlands Bioinformatics Center" /> <img src="NPC_logo.png" width="230" height="80"  style="border: 0px solid ;" alt="Netherlands Proteomics Centre" title="Netherlands Proteomics Centre" />
237<p><a href="https://wiki.nbic.nl/index.php/NBPP" id="NBIC_Wiki_NBPP" title="Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform (NBPP)" target="_blank">Netherlands Bioinformatics for Proteomics Platform</a>
238(<a href="http://www.nbpp.nl" id="NBPP_self" title="NBPP" target="_self"><b>NBPP</b></a>) is joint initiative of the <a href="http://www.nbic.nl" id="NBIC_main_page" title="NBIC" target="_blank">Netherlands Bioinformatics Center</a>
239and the <a href="http://www.netherlandsproteomicscentre.nl" id="NPC_main_page" title="Netherlands Proteomics Centre" target="_blank">Netherlands Proteomics Centre</a>.
240The goal of NBPP is to provide user friendly, high-throughput data processing services to analyse proteomics LC-MS data based on open source tools or tools developed and available within the Platform members. These services are provided by Data Analysis Framework using the <a href="https://grid.sara.nl/wiki/index.php/Life_Science_Grid" id="DLSG_main_page" title="DLSG_main_page" target="_blank">Dutch Life Science Grid</a> and other computational clusters of the platform members.</p>
241<p>We provide for users 10 TB disk space, which can be used to upload the initial input files and store the processed data. Data processing services of DAF are acting only on data stored in user disk space, which can be accessed by user-friendly web upload and download services.</p> 
242<p>The list of available data processing services based on standalone tools can be found under the Services menu, and the list of available workflows can be found under Workflow menu.</p>
243<p>The Platform is only started recently, and the number of available service based on standalone tools is 1 and no workflow is implemented. We are currently working to add new standalone tools and workflows and extend the ability of DAF to connect with web service based workflow managers (e.g Taverna, Kepler) and Galaxy.</p>
244                                </div>
245                        </div>
246                </div>
247        </div>
248       
249        <div class="clear-left"></div>
250
251               
252        <div class="clear-left"></div>
253
254       
255        <!--ENDED MODULE-->
256        <div id="home-ended" class="module-container" style="height:225px;">                   
257                <div class="module-header">
258                        <div class="module-header-right mwide">
259                                <div class="feed-right">
260                                        <a href="#" title="RSS"><img src="http://s3.amazonaws.com/worth1000media/images/feed.png" alt="RSS"/></a>       
261                                </div>                                 
262                        </div>
263                        <div class="module-header-left">
264                                Recently added services
265                        </div>
266                </div>
267<div style="padding-bottom:15px;" >
268        <table summary="" class="hof" >
269        <tr>
270                <td valign="middle"><a href="warp2d.html" style="font-size:18pt;text-decoration:none;" class="mr-v">Warp2D - 2D Time Alignment</a></td>
271        </tr>
272        </table>
273</div>
274
275        </div>
276        <!--/ENDED MODULE-->
277
278    <div class="breaker">&nbsp;</div>
279
280       
281       
282</div>
283                                <div class="clear">&nbsp;</div>
284
285                        </div>
286                </div>
287        </div><!-- /body-proxy-r-->
288        </div><!-- /body-proxy-l-->     
289<script type="text/javascript">
290
291  var _gaq = _gaq || [];
292  _gaq.push(['_setAccount', 'UA-16369638-1']);
293  _gaq.push(['_setDomainName', '.nbpp.nl']);
294  _gaq.push(['_trackPageview']);
295
296  (function() {
297    var ga = document.createElement('script'); ga.type = 'text/javascript'; ga.async = true;
298    ga.src = ('https:' == document.location.protocol ? 'https://ssl' : 'http://www') + '.google-analytics.com/ga.js';
299    var s = document.getElementsByTagName('script')[0]; s.parentNode.insertBefore(ga, s);
300  })();
301
302</script>
303<script type="text/javascript" src="http://d.yimg.com/mi/ywa.js"></script>
304<script type="text/javascript">
305/*globals YWA*/
306var YWATracker = YWA.getTracker("1000589476777");
307YWATracker.setDocumentName("index.html");
308//YWATracker.setDocumentGroup("");
309YWATracker.submit();
310</script>
311<noscript>
312<div><img src="http://a.analytics.yahoo.com/p.pl?a=1000589476777&amp;js=no" width="1" height="1" alt="" /></div>
313</noscript>
314
315        </body>
316</html>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.