Changeset 660

Show
Ignore:
Timestamp:
17-04-12 09:20:31 (2 years ago)
Author:
rob.hooft@…
Message:
  • Put "else" on the same line as preceding "}" (checkstyle)
Location:
trunk/code/conceptwiki/imports
Files:
2 modified

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/code/conceptwiki/imports/imports-swissprot/src/main/java/nl/nbic/conceptwiki/imports/swissprot/UniprotImport.java

    r659 r660  
    198198                // if this mapping has a duplicated CUI, then it should belong to generic protein mapping. 
    199199                genericProteinMapper.put(spId, cId); 
    200             } 
    201             else { 
     200            } else { 
    202201                specificProteinMapper.put(spId, cId); 
    203202            } 
     
    394393                            genePrimaryName = gnt.getValue(); 
    395394                            geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.PREFERRED, gnt.getValue() + " (" + organism + ")", LANG_EN)); 
    396                         } 
    397                         else { 
     395                        } else { 
    398396                            geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.ALTERNATIVE, gnt.getValue(), LANG_EN)); 
    399397                        } 
    400                     } 
    401                     else { 
     398                    } else { 
    402399                        geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.ALTERNATIVE, gnt.getValue(), LANG_EN)); 
    403400                    } 
     
    432429 
    433430                    createNewGenericProteinConcept = false; 
    434                 } 
    435                 else { 
     431                } else { 
    436432                    // there are no or more than 1 concept have the UMLS ID. We will create a new generic protein concept 
    437433                    createNewGenericProteinConcept = true; 
    438434                } 
    439             } 
    440             else { 
     435            } else { 
    441436                createNewGenericProteinConcept = true; 
    442437            } 
     
    471466 
    472467                    genericProteinTag = createdGenericConcept; 
    473                 } 
    474                 else { 
     468                } else { 
    475469                    genericProteinTag = genericConcept; 
    476470                } 
     
    502496 
    503497                        createNewGenericGeneConcept = false; 
    504                     } 
    505                     else { 
     498                    } else { 
    506499                        // there are no concept or more than 1 concepts have the same UMLS ID, sth is wrong and we do not tag to anything. 
    507500                        createNewGenericGeneConcept = true; 
    508501                    } 
    509                 } 
    510                 else { 
     502                } else { 
    511503                    createNewGenericGeneConcept = true; 
    512504                } 
     
    540532 
    541533                        genericGeneTag = createdGenericConcept; 
    542                     } 
    543                     else { 
     534                    } else { 
    544535                        genericGeneTag = genericConcept; 
    545536                    } 
     
    581572                    tagConceptInConceptWikiBranch(concept, genericProteinTag); 
    582573 
    583                 } 
    584                 else { 
     574                } else { 
    585575                    // there are more concepts have the same UMLS ID, sth is wrong and we do not map to anything. 
    586576                    createNewProteinConcept = true; 
     
    639629            uniprotImport.run(); 
    640630            System.out.println("Import took " + (System.currentTimeMillis() - start) + "ms"); 
    641         } 
    642         else { 
     631        } else { 
    643632            logger.error("bootstrap failed"); 
    644633        } 
  • trunk/code/conceptwiki/imports/imports-umls/src/main/java/nl/nbic/conceptwiki/imports/umls/UMLSImport.java

    r659 r660  
    884884                    LOGGER.error("tagConcept {} does not exist", tagCUI);                         
    885885                    continue; 
    886                 } 
    887                 else { 
     886                } else { 
    888887                    tagStorageService.createTag(tagConcept.getUuid()); 
    889888                } 
     
    931930                        LOGGER.error("classConcept {} does not exist", cui1);                         
    932931                        continue; 
    933                     } 
    934                     else { 
     932                    } else { 
    935933                        tagStorageService.createTag(classConcept.getUuid()); 
    936934                    } 
     
    12411239        if (resultConcepts.isEmpty()) { 
    12421240            return null; 
    1243         } 
    1244         else { 
     1241        } else { 
    12451242            return resultConcepts.get(0); 
    12461243        }