Changeset 660


Ignore:
Timestamp:
Apr 17, 2012, 9:20:31 AM (5 years ago)
Author:
rob.hooft@…
Message:
  • Put "else" on the same line as preceding "}" (checkstyle)
Location:
trunk/code/conceptwiki/imports
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/code/conceptwiki/imports/imports-swissprot/src/main/java/nl/nbic/conceptwiki/imports/swissprot/UniprotImport.java

    r659 r660  
    198198                // if this mapping has a duplicated CUI, then it should belong to generic protein mapping.
    199199                genericProteinMapper.put(spId, cId);
    200             }
    201             else {
     200            } else {
    202201                specificProteinMapper.put(spId, cId);
    203202            }
     
    394393                            genePrimaryName = gnt.getValue();
    395394                            geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.PREFERRED, gnt.getValue() + " (" + organism + ")", LANG_EN));
    396                         }
    397                         else {
     395                        } else {
    398396                            geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.ALTERNATIVE, gnt.getValue(), LANG_EN));
    399397                        }
    400                     }
    401                     else {
     398                    } else {
    402399                        geneLabels.add(new LabelImpl(LabelType.ALTERNATIVE, gnt.getValue(), LANG_EN));
    403400                    }
     
    432429
    433430                    createNewGenericProteinConcept = false;
    434                 }
    435                 else {
     431                } else {
    436432                    // there are no or more than 1 concept have the UMLS ID. We will create a new generic protein concept
    437433                    createNewGenericProteinConcept = true;
    438434                }
    439             }
    440             else {
     435            } else {
    441436                createNewGenericProteinConcept = true;
    442437            }
     
    471466
    472467                    genericProteinTag = createdGenericConcept;
    473                 }
    474                 else {
     468                } else {
    475469                    genericProteinTag = genericConcept;
    476470                }
     
    502496
    503497                        createNewGenericGeneConcept = false;
    504                     }
    505                     else {
     498                    } else {
    506499                        // there are no concept or more than 1 concepts have the same UMLS ID, sth is wrong and we do not tag to anything.
    507500                        createNewGenericGeneConcept = true;
    508501                    }
    509                 }
    510                 else {
     502                } else {
    511503                    createNewGenericGeneConcept = true;
    512504                }
     
    540532
    541533                        genericGeneTag = createdGenericConcept;
    542                     }
    543                     else {
     534                    } else {
    544535                        genericGeneTag = genericConcept;
    545536                    }
     
    581572                    tagConceptInConceptWikiBranch(concept, genericProteinTag);
    582573
    583                 }
    584                 else {
     574                } else {
    585575                    // there are more concepts have the same UMLS ID, sth is wrong and we do not map to anything.
    586576                    createNewProteinConcept = true;
     
    639629            uniprotImport.run();
    640630            System.out.println("Import took " + (System.currentTimeMillis() - start) + "ms");
    641         }
    642         else {
     631        } else {
    643632            logger.error("bootstrap failed");
    644633        }
  • trunk/code/conceptwiki/imports/imports-umls/src/main/java/nl/nbic/conceptwiki/imports/umls/UMLSImport.java

    r659 r660  
    884884                    LOGGER.error("tagConcept {} does not exist", tagCUI);                       
    885885                    continue;
    886                 }
    887                 else {
     886                } else {
    888887                    tagStorageService.createTag(tagConcept.getUuid());
    889888                }
     
    931930                        LOGGER.error("classConcept {} does not exist", cui1);                       
    932931                        continue;
    933                     }
    934                     else {
     932                    } else {
    935933                        tagStorageService.createTag(classConcept.getUuid());
    936934                    }
     
    12411239        if (resultConcepts.isEmpty()) {
    12421240            return null;
    1243         }
    1244         else {
     1241        } else {
    12451242            return resultConcepts.get(0);
    12461243        }
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.