Changeset 260


Ignore:
Timestamp:
Mar 14, 2012, 2:53:46 PM (5 years ago)
Author:
tim.te.beek@…
Message:

Add plugin specific cytoscape categories to properties
Only add shade plugin in alternative table import

Location:
trunk
Files:
4 edited
3 moved

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/alternative-table-import/pom.xml

    r258 r260  
    1111        <name>Alternative Table Import</name>
    1212        <description>Cytoscape plugin to load nodes, edges and attributes from comma separated value files.</description>
     13        <properties>
     14                <cytoscape.category>Network and Attribute I/O</cytoscape.category>
     15        </properties>
    1316        <profiles>
    1417                <profile>
     
    7679                                </configuration>
    7780                        </plugin>
     81                        <plugin>
     82                                <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
     83                                <artifactId>maven-shade-plugin</artifactId>
     84                                <version>1.5</version>
     85                                <executions>
     86                                        <execution>
     87                                                <phase>package</phase>
     88                                                <goals>
     89                                                        <goal>shade</goal>
     90                                                </goals>
     91                                        </execution>
     92                                </executions>
     93                        </plugin>
    7894                </plugins>
    7995        </build>
  • trunk/alternative-table-import/src/main/resources/downloadsite.xml

    r258 r260  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
    22<project>
    3         <!-- global info regarding the project these plugins come from -->
    43        <name>NBIC BRS Cytoscape Plugins</name>
    54        <description>Cytoscape Plugins developed by NBIC BRS</description>
    65        <url>${project.organization.url}</url>
    7         <!-- contains all the available plugins -->
    86        <pluginlist>
    9                 <!-- describes a single plugin -->
     7        <!-- describes a single plugin -->
    108                <plugin>
    11                         <!-- id must be the same from one version to the next for updating -->
     9                <!-- id must be the same from one version to the next for updating -->
    1210                        <uniqueID>${project.artifactId}</uniqueID>
    1311                        <name>${project.name}</name>
    1412                        <description>${project.description}</description>
    15                         <!-- versions may only be two numbers separated by a decimal -->
     13                <!-- versions may only be two numbers separated by a decimal -->
    1614                        <pluginVersion>${project.version}</pluginVersion>
    1715
    18                         <!-- compatible with these versions, a separate <version>entry is required for each compatible version -->
     16                <!-- compatible with these versions, a separate <version>entry is required for each compatible version -->
    1917                        <cytoscapeVersions>
    2018                                <version>2.8</version>
     
    2321                        <category>${cytoscape.category}</category>
    2422
    25                         <!-- url to download plugin file from -->
    26                         <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar</url>
     23                <!-- url to download plugin file from -->
     24                        <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar
     25                        </url>
    2726
    28                         <!-- add as many authors as you like -->
     27                <!-- add as many authors as you like -->
    2928                        <authorlist>
    3029                                <author>
     
    3433                        </authorlist>
    3534
    36                         <!-- license is NOT required, if used a license can be embedded in the xml or downloaded from a url -->
     35                        <!-- license is NOT required, if used a license can be embedded in the xml or downloaded from a url -->
    3736                        <license>
    3837                                <url>${license.url}</url>
  • trunk/piqc-plugin/pom.xml

    r258 r260  
    88        </parent>
    99        <artifactId>piqc-plugin</artifactId>
    10         <version>1.6</version>
     10        <version>0.1</version>
    1111        <name>ProteinIdentificationQuantification</name>
    1212        <description>Cytoscape Plugin to load Protein Identification and Quantification data.</description>
     13        <properties>
     14                <cytoscape.category>Analysis</cytoscape.category>
     15        </properties>
    1316        <build>
    1417                <plugins>
  • trunk/piqc-plugin/src/main/resources/downloadsite.xml

    r258 r260  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
    22<project>
    3         <!-- global info regarding the project these plugins come from -->
    43        <name>NBIC BRS Cytoscape Plugins</name>
    54        <description>Cytoscape Plugins developed by NBIC BRS</description>
    65        <url>${project.organization.url}</url>
    7         <!-- contains all the available plugins -->
    86        <pluginlist>
    97                <!-- describes a single plugin -->
     
    2422
    2523                        <!-- url to download plugin file from -->
    26                         <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar</url>
     24                        <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar
     25                        </url>
    2726
    2827                        <!-- add as many authors as you like -->
  • trunk/pom.xml

    r258 r260  
    2222                <license.url>http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.txt</license.url>
    2323                <developer.name>Tim te Beek</developer.name>
    24                 <cytoscape.category>Network and Attribute I/O</cytoscape.category>
    2524                <cytoscape.version>2.8</cytoscape.version>
    2625                <maven.build.timestamp.format>MMMM d, yyyy</maven.build.timestamp.format>
     
    132131                                        <target>1.6</target>
    133132                                        <optimize>true</optimize>
    134                                         <debug>true</debug>
    135133                                        <showDeprecation>true</showDeprecation>
    136134                                        <showWarnings>true</showWarnings>
    137135                                </configuration>
    138                         </plugin>
    139                         <plugin>
    140                                 <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
    141                                 <artifactId>maven-shade-plugin</artifactId>
    142                                 <version>1.5</version>
    143                                 <executions>
    144                                         <execution>
    145                                                 <phase>package</phase>
    146                                                 <goals>
    147                                                         <goal>shade</goal>
    148                                                 </goals>
    149                                         </execution>
    150                                 </executions>
    151136                        </plugin>
    152137                </plugins>
  • trunk/subnetworkcreator-plugin/pom.xml

    r258 r260  
    1111        <name>SubnetworkCreator</name>
    1212        <description>Cytoscape Plugin to create subnetworks for disconnected graphs.</description>
     13        <properties>
     14                <cytoscape.category>Network Inference</cytoscape.category>
     15        </properties>
    1316        <build>
    1417                <plugins>
  • trunk/subnetworkcreator-plugin/src/main/resources/downloadsite.xml

    r258 r260  
    11<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
    22<project>
    3         <!-- global info regarding the project these plugins come from -->
    43        <name>NBIC BRS Cytoscape Plugins</name>
    54        <description>Cytoscape Plugins developed by NBIC BRS</description>
    65        <url>${project.organization.url}</url>
    7         <!-- contains all the available plugins -->
    86        <pluginlist>
    97                <!-- describes a single plugin -->
     
    2422
    2523                        <!-- url to download plugin file from -->
    26                         <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar</url>
     24                        <url>${repository.brs.public}nl/nbic/brs/${project.artifactId}/${project.version}/${project.artifactId}-${project.version}.jar
     25                        </url>
    2726
    2827                        <!-- add as many authors as you like -->
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.